Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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