Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms