Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
SYCP1Q15431 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms