Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms