Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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