Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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