Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms