Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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