Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2P78314 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms