Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPREP23469 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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