Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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