Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 USP40-203ENST00000427112 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02009-201ENST00000635852 2951 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC048380.2-201ENST00000624725 3548 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLITRK1-201ENST00000377084 5189 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC66-201ENST00000343457 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 S1PR3-202ENST00000375846 8505 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMER1-201ENST00000330258 8443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 BDNF-204ENST00000395980 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM16-202ENST00000416464 3184 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms