Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACHD1Q5VU97 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms