Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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CTXN3Q4LDR2 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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CTXN3Q4LDR2 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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CTXN3Q4LDR2 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CTXN3Q4LDR2 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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CTXN3Q4LDR2 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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