Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC96Q2M329 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC96Q2M329 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC96Q2M329 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC96Q2M329 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CCDC96Q2M329 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC96Q2M329 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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