Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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