Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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