Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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