Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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