Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms