Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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