Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms