Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NME3Q13232 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.8 ms