Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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