Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms