Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRGP23470 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.2 ms