Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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