Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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