Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SS18Q15532 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SS18Q15532 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SS18Q15532 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SS18Q15532 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SS18Q15532 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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