Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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DDX39BQ13838 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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DDX39BQ13838 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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DDX39BQ13838 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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