Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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