Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms