Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.6 ms