Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms