Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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