Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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