Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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