Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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