Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms