Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms