Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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