Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms