Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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LMOD1P29536 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMOD1P29536 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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