Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMC1P11047 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMC1P11047 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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