Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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PTPRCP08575 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRCP08575 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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