Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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