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| BRD3 | Q15059 | USP9YP11-201 | ENST00000427537 | 717 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC093414.1-201 | ENST00000434712 | 514 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
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| BRD3 | Q15059 | KCNJ16-211 | ENST00000615244 | 4190 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS6KA5-207 | ENST00000614987 | 26795 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC026951.1-201 | ENST00000559530 | 2459 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004852.2-204 | ENST00000614137 | 1370 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | CPB2-202 | ENST00000439329 | 1655 nt | TSL 5 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AKAP11-201 | ENST00000025301 | 9920 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | NUP35-203 | ENST00000409798 | 1470 nt | TSL 2 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | ADGRL2-203 | ENST00000370713 | 5382 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | STAG2-204 | ENST00000371157 | 5991 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR2B2-201 | ENST00000303324 | 1212 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNA5SP183-201 | ENST00000362452 | 119 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR14A2-201 | ENST00000366485 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR323B-201 | ENST00000385269 | 82 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL355379.1-201 | ENST00000405542 | 640 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | DUTP5-201 | ENST00000406790 | 469 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR1250-201 | ENST00000408098 | 113 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6ATAC21P-201 | ENST00000408656 | 126 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AF015720.1-201 | ENST00000412240 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC093655.2-201 | ENST00000425735 | 631 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL449043.1-202 | ENST00000427318 | 582 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC104257.1-202 | ENST00000524275 | 884 nt | TSL 3 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC092364.1-201 | ENST00000598561 | 471 nt | TSL 3 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073254.1-207 | ENST00000600482 | 714 nt | TSL 5 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022145.1-201 | ENST00000600673 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC013244.3-201 | ENST00000605614 | 388 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL451074.6-201 | ENST00000608512 | 729 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPSAP73-201 | ENST00000614820 | 330 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC109809.1-201 | ENST00000619665 | 545 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR7154-201 | ENST00000620673 | 73 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092184.1-201 | ENST00000625042 | 715 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | PLCB4-203 | ENST00000378493 | 5796 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MYO9A-209 | ENST00000564571 | 8111 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008505.1-201 | ENST00000637582 | 2025 nt | TSL 5 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | F2RL2-201 | ENST00000296641 | 3429 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z98755.1-201 | ENST00000407015 | 1384 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLC38A2-209 | ENST00000551374 | 2802 nt | TSL 2 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTM1-203 | ENST00000370396 | 3593 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AGBL2-201 | ENST00000357610 | 3295 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | KCNJ6-201 | ENST00000609713 | 19645 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.13 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01847-201 | ENST00000522627 | 5607 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.13 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF734P-201 | ENST00000419494 | 1534 nt | BASIC | 5.13 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | WDFY3-201 | ENST00000295888 | 14247 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.13 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | C11orf65-208 | ENST00000615746 | 2711 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.13 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | TJP1-204 | ENST00000400011 | 6764 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.13 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | C1GALT1-202 | ENST00000402468 | 930 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.13 | □□□□□ -1.59 | | |