Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms