Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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