Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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SGCGQ13326 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SGCGQ13326 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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